Диагностическое и прогностическое значение экспрессии длинной некодирующей РНК PROX1‑AS1 и микроРНК miR-647 при раке желудка

Введение. Рак желудка входит в число наиболее распространенных злокачественных новообразований и занимает одно из лидирующих мест в структуре смертности от онкологичеких заболеваний во всем мире. Эпигенетические изменения с участием некодирующих РНК (нкРНК), включая микроРНК и длинные нкРНК, вовлечены в его патогенез и прогрессию и могут являться потенциальными диагностическими и прогностическими биомаркерами.
Цель исследования – оценить экспрессию PROX1-AS1 и miR-647 при раке желудка и изучить ее клиническое значение.
Материалы и методы. В исследование включены 62 парных образца опухоли и неопухолевой ткани желудка, а также 5 секционных образцов ткани желудка без патологии. Анализ экспрессии проведен с помощью метода полимеразной цепной реакции с обратной транскрипцией.
Результаты. Обнаружены достоверные различия экспрессии PROX1-AS1 в опухолевых (р = 0,002) и неопухолевых тканях (р <0,001), полученных от пациентов с раком желудка, относительно секционных тканей желудка без патологии. С помощью коэффициента корреляции Пирсона выявлена отрицательная корреляция между экспрессией PROX1-AS1 и miR-647 в опухолевых (р <0,001) и неопухолевых (р <0,001) тканях пациентов с раком желудка. Показано, что экспрессия PROX1-AS1 и miR-647 связана с распространенностью первичной опухоли.
Заключение. Полученные результаты позволяют предположить потенциальную прогностическую значимость
PROX1-AS1 и miR-647 при раке желудка.

1. Sung H., Ferlay J., Siegel R.L. et al. Global Cancer Statistics 2020: GLOBOCAN estimates of incidence and mortality worldwide for 36 cancers in 185 countries. CA. Cancer J Clin 2021;71(3): 209–49. DOI: 10.3322/CAAC.21660

2. Necula L., Matei L., Dragu D. et al. Recent advances in gastric cancer early diagnosis. World J Gastroenterol 2019;25(17):2029–44. DOI: 10.3748/WJG.V25.I17.2029

3. Fattani S., Nikbakhsh N., Taheri H. et al. Prevalence of multiple infections and the risk of gastric adenocarcinoma development at earlier age. Diagn Microbiol Infect Dis 2018;92(1):62–8. DOI: 10.1016/J.DIAGMICROBIO.2018.04.015

4. Zhou Z., Lin Z., Pang X. et al. Epigenetic regulation of long noncoding rnas in gastric cancer. Oncotarget 2018;9(27):19443. DOI: 10.18632/ONCOTARGET.23821

5. Shi X., Sun M., Liu H. et al. Long non-coding rnas: a new frontier in the study of human diseases. Cancer Lett 2013;339(2):159–66. DOI: 10.1016/J.CANLET.2013.06.013

6. Ling H., Fabbri M., Calin G.A. MicroRNAs and other non-coding rnas as targets for anticancer drug development. Nat Rev Drug Discov 2013;12(11):847–65. DOI: 10.1038/NRD4140

7. Rafiee A., Riazi-Rad F., Havaskary M. et al. Long noncoding RNAs: regulation, function and cancer. Biotechnol Genet Eng Rev 2018;34(2):153–80. DOI: 10.1080/02648725.2018.1471566

8. Rawlings-Goss R.A., Campbell M.C., Tishkoff S.A. Global population-specific variation in MiRNA associated with cancer risk and clinical biomarkers. BMC Med Genomics 2014;7(1):53. DOI: 10.1186/1755-8794-7-53

9. Xie S.S., Jin J., Xu X. et al. Emerging roles of non-coding RNAs in gastric cancer: pathogenesis and clinical implications. World J Gastroenterol 2016;22(3):1213–23. DOI: 10.3748/WJG.V22.I3.1213

10. Yang F., Bi J., Xue X. et al. Up-regulated long non-coding RNA H19 contributes to proliferation of gastric cancer cells. FEBS J 2012;279(17):3159–65. DOI: 10.1111/J.1742-4658.2012.08694.X

11. Sun M., Xia R., Jin F. et al. Downregulated long noncoding RNA MEG3 Is associated with poor prognosis and promotes cell proliferation in gastric cancer. Tumour Biol 2014;35(2):1065–73. DOI: 10.1007/S13277-013-1142-Z

12. Jiang W., Meng K., Yang T. Long non-coding RNA PROX1-AS1 promotes the proliferation and migration in gastric cancer by epigenetically activating FGFR1. Panminerva Med 2019. Available at: https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/31355614/

13. Rudzinska M., Czarnecka-Chrebelska K.H., Kuznetsova E.B. et al. Long non-coding PROX1-AS1 expression correlates with renal cell carcinoma metastasis and aggressiveness. Non-Coding RNA 2021;7(2):25. DOI: 10.3390/NCRNA7020025

14. Tu B., Ye L., Cao Q. et al. Identification of a five-MiRNA signature as a novel potential prognostic biomarker in patients with nasopharyngeal carcinoma. Hereditas 2022;159(1):3. DOI: 10.1186/S41065-021-00214-9

15. Ye X., Qiu R., He X. et al. MiR-647 Inhibits hepatocellular carcinoma cell progression by targeting protein tyrosine phosphatase receptor type F. Bioengineered 2022;13(1):1090–102. DOI: 10.1080/21655979.2021.2017628

16. Liu S., Qu D., Li W. et al. MiR-647 and MiR-1914 promote cancer progression equivalently by downregulating nuclear factor IX in colorectal cancer. Mol Med Rep 2017;16(6):8189–99. DOI: 10.3892/MMR.2017.7675/HTML

17. Zhang X., Zhang M., Wang G. et al. Tumor promoter role of MiR-647 in gastric cancer via repression of TP73. Mol Med Rep 2018;18(4):3744–50. DOI: 10.3892/MMR.2018.9358

18. Ma H., Wang P., Li Y. et al. Decreased expression of serum MiR-647 is associated with poor prognosis in gastric cancer. Int J Clin Exp Pathol 2019;12(7):2552–8.

19. Song X., Bi Y., Guo W. Long noncoding RNA PROX1-AS1 promotes tumor progression and aggressiveness by sponging MiR-647 in gastric cancer. Minerva Med 2021;112(3):421–3. DOI: 10.23736/S0026-4806.19.06223-2

20. Biomedical Informatics Institute. Available at: https://bioinfo.henu.edu.cn/DatabaseList.jsp.

21. Barrett T., Wilhite S.E., Ledoux P. et al. NCBI GEO: archive for functional genomics data sets-update. Nucleic Acids Res 2013;41(D1):D991–5. DOI: 10.1093/NAR/GKS1193

22. Qian Z., Zhu G., Tang L. et al. Whole genome gene copy number profiling of gastric cancer identifies PAK1 and KRAS gene amplification as therapy targets. Genes Chromosom Cancer 2014;53(11):883–94. DOI: 10.1002/GCC.22196

23. GEO Accession viewer. Available at: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE57303.

24. Bure I.V., Nemtsova M.V. Methylation and noncoding RNAs in gastric cancer: everything is connected. Int J Mol Sci 2021;22(11):5683. DOI: 10.3390/IJMS22115683

25. LncACTdb 3.0: Home. Available at: http://bio-bigdata.hrbmu.edu.cn/LncACTdb/.

26. Shen Y., Xia E., Bhandari A. et al. LncRNA PROX1-AS1 promotes proliferation, invasion, and migration in papillary thyroid carcinoma. Biosci Rep 2018;38(5):BSR20180862. DOI: 10.1042/BSR20180862

27. Chen Y., Lu B., Liu L. et al. Long non-coding RNA PROX1-AS1 knockdown upregulates microRNA-519d-3p to promote chemosensitivity of retinoblastoma cells via targeting SOX2. Cell Cycle 2021;20(20):2149–59. DOI: 10.1080/15384101.2021.1971352

28. Guo T., Wang W., Ji Y. et al. LncRNA PROX1-AS1 facilitates gastric cancer progression via miR-877-5p/PD-L1 Axis. Cancer Manag Res 2021;13:2669. DOI: 10.2147/CMAR.S275352

29. Qin K., Tian G., Chen G. et al. MiR-647 inhibits glioma cell proliferation, colony formation and invasion by regulating HOXA9. J Gene Med 2020;22(3):e3153. DOI: 10.1002/JGM.3153

30. Zhang Y.S., Chen T., Cai Y.J. et al. MicroRNA-647 promotes the therapeutic effectiveness of argon-helium cryoablation and inhibits cell proliferation through targeting TRAF2 via the NF-ΚB signaling pathway in non-small cell lung cancer. Onco Targets Ther 2018;11:6777–84. DOI: 10.2147/OTT.S159337

31. Du L., Wang X., Yin Y. et al. Identification of a potentially functional circRNA-miRNA-mRNA ceRNA regulatory network in bladder cancer by analysis of microarray data. Transl Androl Urol 2021;10(1):24–36. DOI: 10.21037/TAU-20-660

32. Cao W., Wei W., Zhan Z. et al. Role of miR-647 in human gastric cancer suppression. Oncol Rep 2017;37(3):1401–11. DOI: 10.3892/OR.2017.5383

33. Yang B., Jing C., Wang J. et al. Identification of microRNAs associated with lymphangiogenesis in human gastric cancer. Clin Transl Oncol 2014;16(4):374–9. DOI: 10.1007/S12094-013-1081-6

34. Zhao Q., Zhang B., Li Z. et al. Effects of incRNA PROX1-AS1 on proliferation, migration, invasion and apoptosis of lung cancer cells by regulating miR-1305. J Healthc Eng 2022;2022:9570900. DOI: 10.1155/2022/9570900