Preview

Успехи молекулярной онкологии

Расширенный поиск

Вирус Эпштейна–Барр у этнических татар: инфицированность и сиквенсные варианты онкогена LMP1

https://doi.org/10.17650/2313-805X-2018-5-3-65-74

Полный текст:

Аннотация

Цель исследования – изучение инфицированности вирусом Эпштейна–Барр (ВЭБ) этнических татар и анализ генетической структуры онкогена вируса, латентного мембранного белка 1 (LMP1), в штаммах вируса татарского происхождения. Материалы и методы. Материалом для исследования служили буккальные смывы 60 студентов Казанского государственного медицинского университета, являющихся этническими татарами (не менее чем в III поколении). Выделенную из смывов ДНК использовали для амплификаци LMP1. Амплифицированные из ДНК буккальных смывов нуклеотидные последовательности образцов LMP1, транслированные в аминокислотные последовательности, подверглись классификации на основании известной и широко используемой в литературе классификации R.H. Edwards и соавт. Результаты. Анализ нуклеотидных и транслированных аминокислотных последовательностей 41-го ампликона LMP1 выявил их гомологию только с 3 вариантами гена из классификации R.H. Edwards и соавт.: 95.8/А (29,3 %; 12/41), Med– (14,6 %; 6/41) и China1 (7,3 %; 3/41). Такие варианты LMP1, как Alaskan, Med+, Chinа2, China3 и NC, не обнаружены. В остальных 20 случаях (48,8 %) спектр обнаруженных мутаций в образцах LMP1 татарского происхождения не позволил их отнести ни к одному из перечисленных выше вариантов онкогена. Из них в 7 случаях (17,1 % всех исследованных образцов) обнаружена моногруппа вариантов LMP1, отличающаяся не только от представителей славян, жителей европейской части России, но и от других казанских образцов, и обозначенная нами, как LMP1-TatK. Остальные 13 образцов LMP1 (31,7 %), не относящихся ни к одной из известных классификаций, сформировали группу, обозначенную нами, как группа LMP1 вне классификации (LMP1ВК). Заключение. Дальнейшее изучение молекулярно-биологических и функциональных свойств LMP1 в группах ВК и TatK, составляющих 48,8 % от числа изученных образцов онкобелка, и анализ особенностей генотипа этнических татар, вероятно, позволят выяснить, оказывают ли определенные штаммы ВЭБ влияние на показатели заболеваемости и смертности злокачественными новообразованиями, в состав которых входят ВЭБ-ассоциированные случаи, у татарского населения.

Об авторах

К. В. Смирнова
НИИ канцерогенеза ФГБУ «Национальный медицинский исследовательский центр онкологии Н.Н. Блохина» Минздрава России; ФГБОУ ВО «Российский национальный исследовательский медицинский университет им. Н.И. Пирогова» Минздрава России
Россия


Н. Б. Сенюта
НИИ канцерогенеза ФГБУ «Национальный медицинский исследовательский центр онкологии Н.Н. Блохина» Минздрава России
Россия


И. В. Ботезату
НИИ канцерогенеза ФГБУ «Национальный медицинский исследовательский центр онкологии Н.Н. Блохина» Минздрава России
Россия


Т. Е. Душенькина
НИИ канцерогенеза ФГБУ «Национальный медицинский исследовательский центр онкологии Н.Н. Блохина» Минздрава России
Россия


А. К. Лубенская
НИИ канцерогенеза ФГБУ «Национальный медицинский исследовательский центр онкологии Н.Н. Блохина» Минздрава России
Россия


А. А. Фроловская
НИИ канцерогенеза ФГБУ «Национальный медицинский исследовательский центр онкологии Н.Н. Блохина» Минздрава России
Россия


С. В. Петров
ГАУЗ «Республиканский клинический онкологический диспансер» Министерства здравоохранения Республики Татарстан
Россия


А. В. Лихтенштейн
НИИ канцерогенеза ФГБУ «Национальный медицинский исследовательский центр онкологии Н.Н. Блохина» Минздрава России
Россия


В. Э. Гурцевич
НИИ канцерогенеза ФГБУ «Национальный медицинский исследовательский центр онкологии Н.Н. Блохина» Минздрава России
Россия


Список литературы

1. Fujiki H., Watanabe T., Suganuma M. Cell-sufaсe nucleolin acts as a central mediator for carcinogenic, anti-carcinogenic, and disease-related ligands. J Cancer Res Clin Oncol 2014;140(7):689–99. DOI: 10.1007/s00432-014-1587-5. PMID: 24469254.

2. Koutsioumpa M., Papadimitriou E. Cellsuface nucleolin as a target for anti-cancer therapies. Recent Part Anticancer Drug Discov 2018;9(2):137–52. PMID: 24251811.

3. Lushnikova A., Ponkratova D., Andreev S. et al. A рossibility for therapy of metastatic cutaneous melanoma with cationic peptides. Eur J Cancer 2017;72(Sl): 127–28.

4. Lushnikova A.A., Ponkratova D.A., Rudakova A.A. et al. The mechanisms of antitumor toxicity in a number of cationic peptides. Modern Science 2017;11:124–6.

5. Lushnikova A.A., Ponkratova D.A., Morozova L.F., Andreev S.M. Induction of apoptosis in cutaneous melanoma cells by cationic peptides. Int Sci J 2017;7– 2(61):75–9.

6. Dang W., Muto Y., Inoue Y. et al. RCSB PDB TI Solution structure of the RRM_1domain of NCL protein. FAUCRDT 2005;12(12). Available at: http://www.rcsb.org/structure/2FC8.

7. Kellenberger E., Rodrigo J., Muller P., Rognan D. Comparative evaluation of eight docking tools for docking and virtual screening accuracy. Proteins 2004;57(2):225–42. DOI: 10.1002/prot. 20149. PMID: 15340911.

8. Site Map User Manual. Schrödinger: LLC. Schrödinger Press, 2009.

9. Glide User Manual. Schrödinger: LLC. Schrödinger Press, 2015.

10. Induced Fit Docking. Schrödinger: LLC. Schrödinger Press, 2009.

11. Du X., Li Y., Xia Y.L. et al. Insights into protein-ligand interactions: mechanisms, models, and methods. Int J Mol Sci 2016;17(2):144–78. DOI: 10.3390/ijms17020144. PMID: 26821017.

12. Balça-Silva J., do Carmo A., Täo H. et al. Nucleolin is expressed in patient-derived samples and glioblastoma cells, enabling improved intracellular drug delivery and cytotoxicity. Exp Cell Res 2018;370(1): 68–77. DOI: 10.1016/j.yexcr.2018.06.005. PMID: 29902537.encoded latent membrane protein LMP1 are required for transformation of rat-1 fibroblasts. J Virol 1993;67(3):1638–46. PMID: 8382313.

13. Kulwichit W., Edwards R.H., Davenport E.M. et al. Expression of the Epstein–Barr virus latent membrane protein 1 induces B cell lymphoma in transgenic mice. Proc Natl Acad Sci USA 1998;95(20):11963–8. PMID: 9751773.

14. Hu L.F., Zabarovsky E.R., Chen F. et al. Isolation and sequencing of the Epstein– Barr virus BNLF-1 gene (LMP1) from a Chinese nasopharyngeal carcinoma. J Gen Virol 1991;72(Pt 10):2399–409. DOI: 10.1099/0022-1317-72-10-2399. PMID: 1681026.

15. Blake S.M., Eliopoulos A.G., Dawson C.W., Young L.S. The transmembrane domains of the EBV-encoded latent membrane protein 1(LMP1) variant CAO regulate enhanced signalling activity. Virology 2001;282(2):278–87. DOI: 10.1006/viro.2001.0828. PMID: 11289810.

16. Farrell P.J. Signal transduction from the Epstein–Barr virus LMP-1 transforming protein. Trends Microbiol 1998;6(5):175–7. PMID: 9614338.

17. Huen D.S., Henderson S.A., Croom-Carter D., Rowe M. The Epstein–Barr virus latent membrane protein-1 (LMP1) mediates activation of NF-kappa B and cell surface phenotype via two effector regions in its carboxy-terminal cytoplasmic domain. Oncogene 1995;10(3):549–60. PMID: 7845680.

18. Dirmeier U., Neuhierl B., Kilger E. et al. Latent membrane protein 1 is critical for efficient growth transformation of human B cells by epstein-barr virus. Cancer Res 2003;63(11):2982–9. PMID: 12782607.

19. Edwards R.H., Seillier-Moiseiwitsch F., Raab-Traub N. Signature amino acid changes in latent membrane protein 1 distinguish Epstein–Barr virus strains. Virology 1999;261(1):79–95. DOI: 10.1006/viro.1999.9855. PMID: 10441557.

20. Feederle R., Klinke O., Kutikhin A. et al. Epstein–Barr virus: from the detection of sequence polymorphisms to the recognition of viral types. Curr Top Microbiol Immunol 2015;390(Pt 1):119–48. DOI: 10.1007/978-3-319-22822-8_7. PMID: 26424646.

21. Neves M., Marinho-Dias J., Ribeiro J., Sousa H. Epstein–Barr virus strains and variations: geographic or disease-specific variants? J Med Virol 2017;89(3):373–87. DOI: 10.1002/jmv.24633. PMID: 27430663.

22. Gurtsevitch V.E., Iakovleva L.S., Shcherbak L.N. et al. The LMP1 oncogene sequence variations in patients with oral tumours associated or not associated with the Epstein–Barr. Mol Biol (Mosk) 2013;47(6):987–95. PMID: 25509860.

23. Hahn P., Novikova E., Scherback L. et al. The LMP1 gene isolated from Russian nasopharyngeal carcinoma has no 30-bp deletion. Int J Cancer 2001;91(6):815–21. PMID: 11275985.

24. Miller W.E., Edwards R.H., Walling D.M., Raab-Traub N. Sequence variation in the Epstein–Barr virus latent membrane protein 1. J Gen Virol 1994;75(Pt 10):2729–40. DOI: 10.1099/0022-1317-75-10-2729. PMID: 7931159.

25. Lawrence J.B., Villnave C.A., Singer R.H. Sensitive, high-resolution chromatin and chromosome mapping in situ: presence and orientation of two closely integrated copies of EBV in a lymphoma line. Cell 1988;52(1):51–61. PMID: 2830981.

26. Lo Y.M., Chan L.Y., Lo K.W. et al. Quantitative analysis of cell-free Epstein– Barr virus DNA in plasma of patients with nasopharyngeal carcinoma. Cancer Res 1999;59(6):1188–91. PMID: 10096545.

27. Botezatu I.V., Kondratova V.N., Shelepov V.P., Lichtenstein A.V. DNA melting analysis: application of the “open tube” format for detection of mutant KRAS. Anal Biochem 2011;419(2):302–8. DOI: 10.1016/j.ab.2011.08.015. PMID: 21889482.

28. Senyuta N., Yakovleva L., Goncharova E. et al. Epstein–Barr virus latent membrane protein 1 polymorphism in nasopharyngeal carcinoma and other oral cavity tumors in Russia. J Med Virol 2014;86(2): 290–300. DOI: 10.1002/jmv.23729. PMID: 24009107.

29. Li H.P., Chang Y.S. Epstein–Barr virus latent membrane protein 1: structure and functions. J Biomed Sci 2003;10(5):490– 504. DOI: 10.1159/000072376. PMID: 12928589.

30. Kanai K., Satoh Y., Saiki Y. et al. Difference of Epstein–Barr virus isolates from Japanese patients and African Burkitt’s lymphoma cell lines based on the sequence of latent membrane protein 1. Virus Genes 2007;34(1):55–61. DOI: 10.1007/s11262-006-0010-y. PMID: 16917741.

31. Wilmes E., Wolf H., Haus M. Tonsillar cancer and Epstein–Barr virus. Laryngol Rhinol Otol (Stuttg) 1983;62(12):586–9. PMID: 6323895.

32. Wu L.Y., Cheng J., Lu Y. et al. Epstein– Barr virus infection in benign lymphoepithelial lesions with malignant transformation of salivary glands. Zhonghua Kou Qiang Yi Xue Za Zhi 2004;39(4):291–3. PMID: 15454012.

33. Ayadi W., Khabir A., Hadhri-Guiga B. et al. North African and Southeast Asian nasopharyngeal carcinomas: between the resemblance and the dissemblance. Bull Cancer 2010;97(4):475–82. DOI: 10.1684/bdc.2010.1090. PMID: 20385521.

34. Namikawa T., Fujisawa K., Munekage E. et al. Epstein–Barr virus-associated early gastric carcinoma with lymphoid stroma, accompanied with lymph node metastasis. Mol Clin Oncol 2018;8(4):561–6. DOI: 10.3892/mco.2018.1567. PMID: 29541465.

35. Alexander F.E., Jarrett R.F., Lawrence D. et al. Risk factors for Hodgkin’s disease by Epstein–Barr virus (EBV) status: prior infection by EBV and other agents. Br J Cancer 2000;82(5):1117–21. DOI: 10.1054/bjoc.1999.1049. PMID: 10737396.

36. Andreone P., Gramenzi A., Lorenzini S. et al. Posttransplantation lymphoproliferative disorders. Arch Intern Med 2003;163:1997–2004. DOI: 10.1001/ archinte.163.17.1997. PMID: 14504111.

37. Состояние онкологической помощи населению России в 2016 году. Под ред. А.Д. Каприна, В.В. Старинского, Г.В. Петровой. М.: МНИОИ им. П.А. Герцена – филиал ФГБУ «НМИЦ радиологии» Минздрава России, 2017. 236 с.


Для цитирования:


Смирнова К.В., Сенюта Н.Б., Ботезату И.В., Душенькина Т.Е., Лубенская А.К., Фроловская А.А., Петров С.В., Лихтенштейн А.В., Гурцевич В.Э. Вирус Эпштейна–Барр у этнических татар: инфицированность и сиквенсные варианты онкогена LMP1. Успехи молекулярной онкологии. 2018;5(3):65-74. https://doi.org/10.17650/2313-805X-2018-5-3-65-74

For citation:


Smirnova K.V., Senyuta N.B., Botezatu I.V., Dushenkina T.E., Lubenskaya A.K., Frolovskaya A.A., Petrov S.V., Lichtenstein A.V., Gurtsevitch V.E. Epstein–Barr virus in the ethnic Tatars population: the infection and sequence variants of LMP1 oncogene. Advances in molecular oncology. 2018;5(3):65-74. (In Russ.) https://doi.org/10.17650/2313-805X-2018-5-3-65-74

Просмотров: 127


Creative Commons License
Контент доступен под лицензией Creative Commons Attribution 4.0 License.


ISSN 2313-805X (Print)
ISSN 2413-3787 (Online)