Поиск и применение генетических прогностических и предиктивных биомаркеров колоректального рака (КРР) направлены на выявление особенностей колоректальных опухолей для выбора стратегии терапии. В статье обобщены результаты научных и клинических исследований по этой теме. Цель работы – проанализировать и обобщить мировую практику использования генетических и эпигенетических изменений в качестве прогностических и предсказательных биомаркеров при инициации и прогрессировании КРР. В статье проанализированы данные исследований, опубликованных в российских и международных базах данных научного цитирования: РИНЦ (Российский индекс научного цитирования), Medline и PubMed. Рассмотрены основные фенотипы патогенеза КРР, а также их возможные функциональные пересечения при развитии заболевания. Также проанализированы уже используемые в мировой клинической практике и потенциальные, перспективные биомаркеры, в том числе экспрессия генов, для выявления подгрупп пациентов повышенного онкологического риска на ранних стадиях КРР. С позиции персонализированной медицины в качестве нового подхода к диагностике и прогнозу в качестве биомаркеров рассматриваются дериваты опухоли в биологических средах, выявляемые при жидкостной биопсии: циркулирующие опухолевые клетки, циркулирующие ДНК, микроРНК, длинные некодирующие РНК. Выявлено, что совместное использование биомаркеров позволяет улучшить прогноз и выбрать оптимальное терапевтическое воздействие. Результаты анализа данных литературы подтверждают, что современные методы генетического анализа вносят значимый вклад в понимание молекулярных механизмов прогрессирования КРР и его устойчивости к противоопухолевой терапии, что облегчает выбор наиболее правильной стратегии лечения. Для оценки потенциала отдельных биомаркеров или биомаркерных панелей КРР необходимы крупномасштабные стандартизированные исследования и проверка этих биомаркеров в рамках проспективных международных программ.

Вирус Эпштейна–Барр (ВЭБ) широко распространен среди населения планеты и обусловливает возникновение многих злокачественных новообразований человека. Механизм ВЭБ-ассоциированного канцерогенеза заключается в способности вирусных белков и микроРНк вызывать генетические и эпигенетические изменения, которые могут прямо или косвенно стимулировать клеточный рост, ингибируя апоптоз или защищая опухолевые клетки от влияния, оказываемого на них микроокружением и иммунным ответом хозяина, приводить к развитию таких злокачественных новообразований, как лимфома Беркитта, лимфома Ходжкина, рак носоглотки, желудка и др. В обзоре рассмотрены молекулярные механизмы канцерогенеза, ассоциированного с ВЭБ, способствующие выживанию этого вируса в клетках хозяина и регулирующие онкобелки. проанализированы результаты более 500 исследований, проведенных преимущественно в последние 10 лет, из баз данных PubMed, Google Scholar, ResearchGate, Web of Science, РиНЦ (Российский индекс научного цитирования) и CyberLeninka.

Анализ научной литературы показал, что ВЭБ обладает большим арсеналом механизмов для уклонения от иммунного надзора, что обеспечивает его пожизненную персистенцию в организме человека. ключевую роль в этом играет экспрессия латентных белков (в частности, EBNA1, LMP1 и LMP2A), которые модулируют сигнальные пути клеток хозяина, подавляют апоптоз и изменяют иммунный ответ. Также установлено, что тип латентности, поддерживаемый в инфицированных клетках, влияет на вероятность злокачественной трансформации. Например, латентность II типа характерна для большинства эпителиальных опухолей, тогда как латентность III типа ассоциирована с лимфомами. переход из латентной в литическую фазу сопровождается экспрессией белков, способствующих онкогенезу. Особое внимание в литературе уделяется роли онкопротеинов LMP1 и LMP2A, которые активируют PI3K/AKT и JAK/STAT пути, нарушая регуляцию клеточной пролиферации и апоптоза. ВЭБ-индуцированные опухоли часто характеризуются эпигенетическими изменениями, поддерживающими вирусную персистенцию и рост опухолевых клеток. Таким образом, ВЭБ способен оказывать мультифакторное влияние на клетку-хозяина, что делает его важным объектом изучения в онковирусологии. Это подтверждает необходимость дальнейших исследований для уточнения молекулярных механизмов канцерогенеза и разработки таргетных терапевтических подходов к лечению ВЭБ-ассо циированных опухолей.

В статье представлена новая классификационная система рака эндометрия, разработанная Международной федерацией акушеров и гинекологов (International Federation of Gynecology and Obstetrics, FIGO), – FIGO 2023. поиск литературы осуществляли в базах данных PubMed, Medline, РиНЦ (Российский индекс научного цитирования) по ключевым словам «рак эндометрия», «молекулярно-генетическое исследование», «FIGO 2023», «мутации гена POLE», «dMMR-статус», «ген ТР53», «NSMP». по теме найдены 206 статей (опубликованы с 1983 по 2024 г.), более значимые из них (45 статей) включены в данный обзор литературы. Обновленная классификация FIGO 2023 содержит 19  под стадий рака эндометрия: 5 из них объединены в стадию I, 3 – в стадию II, 8 – в стадию III, 3 – в стадию IV. Основными ее отличиями от классификационной системы FIGO 2009 являются уточнение типа опухоли (агрессивный/не агрессивный), степени лимфоваскулярной инвазии, наличия макро- или микрометастазов в лимфатических узлах, а также характеристика молекулярно-генетических маркеров. Согласно новой классификации FIGO 2023 рекомендовано изменение стадии в зависимости от наличия мутации в генах POLE и ТР53. Так, к IA подстадии относят опухоли с благоприятным прогнозом и мутацией в гене POLE (IAmPOLEmut стадия), к IIC подстадии – опухоли с неблагоприятным прогнозом и мутацией в гене ТР53 (IICmp53abn стадия). Согласно данным, полученным в ходе исследований, выделенные подстадии с учетом молекулярного профиля опухоли значительно различаются по результатам течения заболевания.

Введение новой классификации FIGO 2023, учитывающей молекулярно-биологические аспекты опухоли, позволит индивидуализировать тактику ведения пациенток, страдающих раком эндометрия, а также прогнозировать течение заболевания. Актуальным вопросом остается дальнейшее изучение отдаленных результатов адъювантной терапии.

Клетки нейробластомы, сарком мягких тканей, остеосаркомы, саркомы Юинга и некоторых других опухолей у детей и взрослых способны экспрессировать дисиалоганглизид GD2. Включение в протоколы терапии нейробластомы анти-GD2-моноклональных антител позволило улучшить результаты лечения. проводятся исследования эффективности использования этих моноклональных антител и при других опухолях.

В данном обзоре описаны основные клеточные и молекулярные процессы, происходящие при пассивной анти-GD2 иммунотерапии при опухолях детского возраста, а также факторы, способные повлиять на них. Мы пришли к выводу, что ведущую роль в развитии цитотоксичности играет антителозависимая клеточная цитотоксичность, реализуемая естественными киллерами по классическому механизму с индукцией каспазазависимого апоптоза, а также макрофагами и нейтрофилами посредством фагоцитоза, трогоцитоза и прямой цитотоксичности. Эффективному фагоцитозу способствует экспрессия кальретикулина опухолевыми клетками и рецептора LRP1 фагоцитами, а уклонению от фагоцитоза – экспрессия опухолевыми клетками CD47 и его взаимодействие с SIRPα на фагоцитах. параллельно происходит активация Т-клеточного адаптивного иммунного ответа. использование гранулоцитарного и гранулоцитарно-макрофагального колониестимулирующих факторов может усиливать цитотоксичность. Добавление экзогенного интерлейкина 2 не повышает эффективность лечения, а применение интерлейкинов 15 и 21 усиливает цитотоксичность in vitro, что требует проведения клинических исследований. комплементзависимая цитотоксичность, вероятно, не оказывает влияния на терапевтическую эффективность пассивной анти-GD2-иммунотерапии. Опухолевое микроокружение и молекулярные особенности иммунокомпетентных клеток могут влиять на анти-GD2 опосредованную цитотоксичность, особенно при совместном использовании анти-GD2 моноклональных антител и ингибиторов рецептора программируемой клеточной гибели 1 (PD-1). Таким образом, дальнейшее изучение данного вопроса особенно актуально. Анти-GD2-моноклональные антитела могут снижать пролиферативную активность и индуцировать апоптоз опухолевых клеток путем ингибирования сигнальных путей (главным образом PI3K/Akt/mTOR), транскрипционных факторов, комплексов фокальной адгезии и интегринов. Вероятны и механизмы индукции митохондриальнозависимой клеточной гибели, имеющей признаки апоптоза и некроза.

Ферроптоз (ФП) – один из видов неапоптотической программируемой гибели клеток, связанной с железозависимым перекисным окислением липидов. при нем наблюдаются снижение активности глутатионпероксидазы 4 (GPX4), необходимой для подавления перекисного окисления липидов, накопление редокс-активного железа и окисление фосфолипидов клеточной мембраны, содержащих полиненасыщенные жирные кислоты. ФП играет главную роль в механизмах старения организма человека, регулируя дегенерацию – основную причину повреждения тканей и органной недостаточности. Он вносит значительный вклад в развитие возрастных патологий, включая нейроде генеративные состояния, сердечно-сосудистые заболевания и рак. Особый интерес представляет участие ФП в патогенезе возрастзависимых онкологических заболеваний, включая острый миелоидный лейкоз (ОМЛ). проведенные ранее исследования показывают, что ФП в значительной степени регулирует чувствительность клеток ОМЛ к химио терапевтическим препаратам, а некоторые из генов, связанные с ним, играют жизненно важную роль в онкогенезе ОМЛ. кроме того, представляют интерес исследования влияния иммунной инфильтрации на ФП и прогноз ОМЛ. Таким образом, углубленное изучение уникального механизма ФП при ОМЛ может дать новые представления о диагностике и лечении этого заболевания.

В данном обзоре проанализированы основные регуляторные молекулярные механизмы ФП и его взаимосвязь с возникновением и развитием ОМЛ. кроме того, обобщены последние достижения в изучении роли ФП в прогнозе и терапии данной патологии.

Введение. Метастатическая меланома кожи (мМк) характеризуется крайне неблагоприятным прогнозом. Значимая ремиссия мМк связана с применением вемурафениба, блокирующего пролиферацию клеток с мутацией в гене BRAF. Однако после отмены этого препарата быстро развивается рецидив, вызывающий необходимость продолжения лечения. поиски другой терапевтической мишени в первичной мМк привели к малочисленной субпопуляции стволовоподобных клеток, экспрессирующих антиген CD20. пилотные клинические испытания ритуксибама, блокирующего CD20, не дали ожидаемых результатов. Мы расценили это как отсутствие контроля над экспрессией СD20 в рецидивных клетках, что доступно только in vivo в адекватной модели рецидивирующей мМк / BRAF⁺ человека с высокой экспрессией СD20.

Цель исследования – создание модели in vivo рецидивирующей мМк / BRAF⁺ человека и оценка представленности субпопуляции клеток с экспрессией CD20.

Материалы и методы. В исследовании использованы вемурафениб (Roche, Швейцария), культура клеток меланомы человека MelCher5k / BRAF⁺ и иммунодефицитные мыши-самцы Balb / c nude массой тела 20–23 г, разведенные и содержащиеся в Национальном медицинском исследовательском центре онкологии им. Н. Н. Блохина. Животных с трансплантированной опухолью (n = 12) распределяли по 2 группам: с применением вемурафениба (экспериментальная группа) и без него (группа контроля). Сравнительную оценку динамики роста опухолевых узлов в группах проводили по соотношению объемов с помощью стандартного критерия Т / С (treatment / control), выраженному в процентах. Динамику экспрессии маркеров S100, CD20 и CD45 определяли методом проточной цитофлуориметрии до начала введения вемурафениба и в конце наблюдения.

Результаты. У мышей с MelCher5k / BRAF⁺, получавших вемурафениб с 7-х по 21-е сутки, с 10-х суток наблюдалась редукция опухоли с полной ремиссией к 20-м суткам. Рецидивы с развитием опухолевого узла в месте имплантации (возобновленный рост клеток меланомы) возникали на 28-е сутки (через неделю после отмены препарата), а затем в течение 34–41-х суток опухоль быстро прогрессировала. У мышей, получавших вемурафениб, доля CD20⁺-клеток в новом очаге составила 35 %, что в 1,82 раза превысило долю CD20⁺-клеток в опухоли мышей, не получавших этот препарат (19 %). при этом клетки вновь возникшей опухоли экспрессировали маркер меланомы S100 и не экспрессировали СD45.

Заключение. In vivo на модели MelCher5k / BRAF⁺ показано, что в рецидивном опухолевом узле, развивающемся после применения вемурафениба, значительно увеличивается доля стволовоподобных клеток, экспрессирующих CD20. Эти данные свидетельствуют о целесообразности использования разработанной модели для оценки клинической перспективности направленных на СD20 агентов, способных продлить ремиссию после отмены вемурафениба при рецидивирующей меланоме.

Введение. Одним из ключевых компонентов клеточных мембран являются мембранные белки, обеспечивающие широкий спектр функций – от транспорта и передачи сигналов до координации межклеточных взаимодействий. Среди них особый интерес представляет натрийзависимый фосфатный транспортер NaPi2b, играющий большую роль в поддержании гомеостаза фосфатов и содержащийся в большом количестве в ряде опухолевых клеток. В состав большого внеклеточного домена (ВКД) NaPi2b входит эпитоп MX35, который представляет значительный интерес в контексте разработки моноклональных антител для таргетной терапии карциномы яичника и легкого. Рас познавание эпитопа MX35 зависит от конформации большого ВкД, обусловленной дисульфидными связями и гликозилированием. Между двумя остатками цистеина – С322 и С328 – находится остаток пролина P325, который, как мы предполагаем, может участвовать в формировании конформации большого ВКД NaPi2b посредством образования дисульфидной связи С322–С328, влияющей на взаимодействие моноклональных антител и эпитопа MX35.

Цель исследования – изучение влияния остатка пролина в положении 325 в области большого ВКД транспортера NaPi2b на взаимодействие моноклональных антител L3(28/1) с эпитопом MX35.

Материалы и методы. В исследовании использованы клеточные линии эпителиальной карциномы яичника чело века OVCAR-8 и OVCAR-4. путем сайт-направленного мутагенеза остаток пролина P325 NaPi2b заменили на остаток аланина, в результате чего были получены клетки OVCAR-8, стабильно экспрессирующие мутантный вариант NaPi2bp.P325A. С помощью вестерн-блот-анализа и лазерной конфокальной микроскопии изучено влияние замены p.P325A NaPi2b на взаимодействие моноклональных антител L3(28/1) и эпитопа МХ35. Для определения влияния мутации p.P325A на формирование дисульфидных связей в большом ВКД NaPi2b проводили модификацию тиоловых групп остатков цистеина с использованием малеимидсодержащих соединений.

Результаты. Выявлено, что замена p.P325A NaPi2b не оказывает значительного влияния на распознавание эпитопа MX35 антителами L3(28/1) как при вестерн-блот-анализе, так и при конфокальной микроскопии. количество дисульфидных связей в большом ВКД NaPi2bp.P325A не менялось по сравнению с NaPi2b дикого типа.

Заключение. Замена p.P325A транспортера NaPi2b не оказывает значимого влияния на распознавание эпитопа MX35 антителами и формирование дисульфидных связей в большом ВКД NaPi2b. Дальнейшие исследования могут быть направлены на более детальное изучение роли других замен в большом ВКД NaPi2b и их влияния на доступность эпитопа для антител.

Введение. использование гипометилирующих агентов в терапии острого миелоидного лейкоза позволило увеличить общую выживаемость пациентов на 12 %. Однако, наряду с мощным противоопухолевым эффектом, эти агенты оказывают негативное влияние на стабильность генома из-за транспозиции активированных LINE1, чем обусловлена малая продолжительность ремиссии. поскольку для ретротранспозиции LINE1 необходима кодируемая ими обратная транскриптаза ORF2 LINE1, гомологичная ферменту ретровирусов, мы предложили использовать гипометилирующие агенты в комбинации с ненуклеозидным ингибитором этого фермента, чтобы снизить генотоксическое действие 5-азацитидина.

Цель исследования – оценить влияние эфавиренза на эффекты 5-азацитидина в отношении культивируемых клеток острого миелоидного лейкоза: цитотоксическую активность, экспрессию длинных диспергированных повторов LINE1 и уровень генетической нестабильности. Материалы и методы. исследование проведено на клетках острого миелоидного лейкоза THP-1 и KG-1. В качестве гипометилирующих агентов и ингибитора обратной транскриптазы использованы 5-азацитидин и эфавиренз соот ветственно. Цитотоксическое действие препаратов и их комбинаций определяли с помощью резазуринового теста, долю апоптотических и некротических клеток оценивали с использованием проточной цитофлуориметрии, экспрессию LINE1 – с помощью полимеразной цепной реакции в реальном времени. Для оценки уровня повреждения ДНК применяли метод ДНК-комет.

Результаты. Выявлено отсутствие влияния эфавиренза на цитотоксичность 5-азацитидина. С помощью иммунофлуо ресцентного окрашивания 2-го кодируемого LINE1 белка – ORF1 – и проточной цитометрии продемонстрировано отсутствие воздействия эфавиренза на уровень экспрессии LINE1. В то же время данные теста ДНК-комет свидетельствуют о снижении генотоксического эффекта 5-азацитидина при его использовании в комбинации с эфавирензом.

Заключение. Результаты нашего исследования впервые показали перспективность развития нового подхода к терапии острого миелоидного лейкоза с использованием гипометилирующих агентов путем их комбинации с ингибиторами обратной транскриптазы.

Введение. В связи с неоднозначной ролью нейтрофилов в канцерогенезе актуальным является изучение их фенотипической трансформации и субпопуляционного состава, определяющего проопухолевый (CD15⁺CD66b⁺) или противоопухолевый (CD62L⁺CD63⁺) потенциал.

Цель исследования – оценка динамики субпопуляций циркулирующих нейтрофилов CD15⁺CD66b⁺, CD62L⁺CD63⁺ у пациентов c доброкачественными новообразованиями почки и у больных с прогрессированием рака почки.

Материалы и методы. Объектом исследования явились циркулирующие нейтрофилы пациентов c доброкачественными новообразованиями почки и больных раком почки. количество нейтрофилов монопопуляций CD15⁺, CD66b⁺, CD62L⁺, CD63⁺, CD95⁺ и субпопуляций CD15⁺CD66b⁺, CD62L⁺CD63⁺ оценивали с помощью проточной цитометрии (BioSino, китай). Статистическую обработку проводили с использованием программ Statistica 13 и Jamovi 2.3.28.

Результаты. Выявлено значимое повышение количества монопопуляций нейтрофилов CD15⁺, CD62L⁺ и CD66b⁺ у пациентов с доброкачественными новообразованиями почки и у больных раком почки, а также количества CD15⁺CD66b⁺-нейтрофилов у пациентов с доброкачественными опухолями почки и у больных раком почки I–II стадии по сравнению с контролем. Доля CD62L⁺CD63⁺-нейтрофилов у больных с доброкачественными новообразованиями была в 3 раза выше, чем у больных раком почки I–II стадии, и в 2 раза выше, чем у больных распространенным раком почки. В регрессионной модели кокса изменение количества CD15⁺CD66b⁺- и CD62L⁺CD63⁺-нейтрофилов на фоне увеличения количества лейкоцитов служит прогностическим маркером рака почки для пациентов старше 68 лет.

Заключение. количество циркулирующих нейтрофилов с проопухолевым фенотипом CD15⁺CD66b⁺ при доброкачественных новообразованиях почки выше по сравнению с контролем и сохраняется на этом уровне на всех стадиях канцерогенеза. количество циркулирующих нейтрофилов противоопухолевого фенотипа CD62L⁺CD63⁺ значимо возрастает при доброкачественных новообразованиях почки и снижается на всех стадиях канцерогенеза. Оценка фенотипа циркулирующих нейтрофилов позволяет определить риск возникновения новообразований почки.

Введение. В основе некоторых цитостатиков лежат продукты растительного происхождения. Разработка новых противоопухолевых средств на основе метаболитов растений является перспективным и актуальным направлением в онкологии. Ранее путем экстракции из корневищ белокопытника гибридного (Petasites hybridus (L.)) мы получили соединение, которое расшифровано и идентифицировано как индольный алкалоид P1, близкий по строению к коринану.

Цель исследования – определение возможности связывания алкалоида, выделенного из Petasites hybridus (L.), с молекулярными мишенями, обусловливающими канцерогенез и опухолевый рост, оценка его действия на состояние культур опухолевых и нормальных клеток.

Материалы и методы. исследование проведено in silico методом молекулярного докинга и in vitro культуральными методами. Молекулярный докинг алкалоида Р1 с рецепторами эпидермального фактора роста (EGFR), тромбоцитарного фактора роста (PDGFR), MET, MRP2 и NOX4 выполнен с использованием программного обеспечения AutoDock Vina 4.0. Сетка области докинга построена в программе AutoDockTools 1.5.7. культуральные исследования проводили на культуре опухолевых высокоэкспрессирующих EGFR (Н1299) и неопухолевых (нормальные фибробласты легкого) клеток человека. клетки культивировали с различными концентрациями алкалоида, их жизнеспособность оценивали с помощью ХТТ-теста и метода прямого подсчета живых и погибших клеток.

Результаты. Максимальный показатель энергии связывания Р1 с молекулярными мишенями получен для МеТ (–8,6 ккал/моль), минимальный – для NOX4 (–5,9 ккал/моль). Энергия связывания Р1 с EGFR составила –6,4; с PDGFR –7,2; с MRP2 –6,3 ккал/моль. Связывание Р1 происходило с аминокислотными остатками активных центров большинства исследованных рецепторов.

Алкалоид Р1 способен подавлять рост культуры аденокарциномы легкого Н1299 в широком диапазоне концентраций более активно, чем в культуре нормальных фибробластов легкого: концентрация полумаксимального ингибирования Р1 составила 127,24 и 256,29 мкмоль/л соответственно. Максимальные различия количества погибших клеток линии Н1299 по сравнению с фибробластами наблюдались при концентрациях алкалоида 21,7–87 мкмоль/л, однако, несмотря на признаки нарушения митоза в виде наличия крупноядерных и многоядерных клеток культуры Н1299 при действии алкалоида, митотический индекс не менялся.

Заключение. Алкалоид, выделенный из белокопытника гибридного, способен связываться с мишенями, опосредующими опухолевый рост, повреждает клетки культуры аденокарциномы легкого Н1299. В связи с этим необходимы дальнейшие исследования его возможного противоопухолевого действия на моделях in vitro и in vivo.